2016年11月10日至11日，陳琪副院長應邀率團訪問菲律賓國立大學。菲律賓國立大學校長Alfredo Fermin Espinosa Pascual、菲律賓國立大學迪利曼分校校長Michael Lim Tan、該校社會科學與哲學學院副院長Herman Jospeph S. Kraft等參與會見，雙方就學生互換、課題研究、共同舉辦學術會議等進行了讨論交流。

代表團一行會後參觀了該校社會科學與哲學學院，該院心理學系、曆史系的教授參加座談，就學生培養、博士生論壇等問題進行了讨論。

之後，代表團一行還參觀了該校亞洲研究中心，中心院長Joefe B. Santarita、副教授Rolando G. Talampas、助理教授Henelito A. Sevilla等參與會見，雙方就亞洲安全形勢、中菲關系發展進行了深入探讨。

陳琪副院長一行還拜訪了中國駐菲律賓大使館，與大使館政務參贊賀湘琦、一秘郁俊等就中菲關系、中菲經貿發展問題進行溝通交流。